این فیلم داستان ناگفته شکل‌گیری قدرتمندترین تیم جهش‌یافته‌ها را در بحبوحه جنگ سرد و بحران موشکی کوبا روایت می‌کند. در این زمان پرآشوب، چارلز اگزیویر جوان، که هنوز با توانایی‌های ذهنی خود دست و پنجه نرم می‌کند، با اریک لنشر، مردی با گذشته‌ای تاریک و قدرت‌های فلز-کنترلی، متحد می‌شود. آن‌ها با همکاری مشترک، گروهی از جهش‌یافته‌های جوان را جمع‌آوری می‌کنند تا از بشریت در برابر یک دشمن مشترک، سباستین شاو، محافظت کنند. شاو یک جهش‌یافته توانا و بی‌رحم است که قصد دارد با آغاز جنگ هسته‌ای، جهان را به نفع جهش‌یافته‌ها تغییر دهد