استان فیلم “قندهار” درباره‌ی تام هریس است، یک عامل مخفی آزاد که تحت قرارداد با سازمان سیا به عنوان یک عامل موثر فعالیت می‌کند. وظیفه‌ی تام هریس این است که وارد یک مرکز تحقیقات هسته‌ای در ایران شده و بدافزاری را به داخل آن وارد کند. او در نقش یک تکنسین میدانی به عنوان کاور یک پیمانکار ارتباطات بلژیکی عمل می‌کند. ماموریت تام هریس موفق می‌شود و بدافزار باعث تخریب تسهیلات هسته‌ای مذکور می‌شود.